凌云峰禅房中，甄嬛终于决定和相爱的果郡王在一起，二人许下终身之约。
皇帝新宠叶氏入宫后即封为答应，此举违背祖制，引起后宫其他众嫔妃的不满。皇后无意间得知齐妃对儿子三阿哥的前途野心勃勃，于是欲除掉齐妃。
皇后暗中点拨齐妃小心皇上新宠叶氏，齐妃明白皇后用意，认为叶氏得宠有孕，必将影响自己儿子的前途。齐妃命太医配好九寒汤送给叶氏服用，叶氏明知有诈，毅然喝下汤药导致腹痛。皇帝得知叶氏从此失去生育能力后震怒，命人彻查究竟。
种种证据指向齐妃，齐妃百口莫辩，只得向皇后哭诉求情，此举正中皇后的圈套，皇后告诉齐妃她已不会赢得皇帝欢心以及“子凭母贵”的道理，齐妃眼见儿子与皇后亲热的情景，深知自己的罪行会连累儿子前途。齐妃托付皇后照顾皇长子弘时，绝望自杀。
后宫甄嬛传分集剧情介绍 第五十二集皇帝及众人以为齐妃系畏罪自杀，死后无封。皇后收养皇长子弘时。
眉庄同情叶氏遭遇前来拜访，得知叶氏根本不爱皇帝，无意得宠。除去了齐妃，皇后在后宫的地位更加牢固，到处是自己的势力。太后看在眼里内心焦急，找来皇后对其进行教诲，岂料皇后如今已是羽翼丰满，言语中不断冲撞太后。
叶氏因九寒汤一事受屈，皇帝晋升其为宁贵人，但叶氏根本不在乎这些称谓。御花园中，叶澜依巧遇果郡王，欣喜不已，并对其吐露心声，说出自己将永念允礼昔日救命之恩，希望来日报答。果郡王让叶氏自己珍重。
果郡王允礼奉皇帝旨意出巡滇藏，与甄嬛相约回来后两人以假死药出逃。眉庄暗地探访甄嬛，告诉甄嬛其父在外一直被果郡王派人暗中保护着;但果郡王刚赴滇藏，甄父便传来病危的消息。
后宫甄嬛传分集剧情介绍 第五十三集甄嬛明白此举应为瓜尔佳氏所为，恨自己不能出力，眉庄劝甄嬛自保为先。
果郡王逾期未归，甄嬛发现自己有了身孕，欣喜之际却从温实初口中得知允礼已惨死他乡的噩耗。甄嬛有孕，求死不得，为保住腹中允礼的孩子，为复仇雪恨，甄嬛决意设计回宫。
槿汐为促成甄嬛回宫，甘愿自我牺牲，入宫找到皇帝身边大太监苏培盛，作其“对食”妻子;苏培盛深受感动，答应助甄嬛一臂之力。
苏培盛以为太后祈福为由，请皇帝入甘露寺进香，皇帝欣然前往。甄嬛费尽心机获得皇帝的注目，加之皇帝本就对其余情未了，两人迅速复合，甄嬛在寺中侍寝。
后宫甄嬛传分集剧情介绍 第五十四集皇帝回宫后，隐瞒与甄嬛私会的消息。不久，甄嬛称自己怀孕;苏培盛请来温实初亲自为其把脉，温实初明白甄嬛回宫复仇的用意，知道相劝也是无果，只能鼎力相助。皇帝得知甄嬛怀孕，意欲接甄嬛回宫。皇后听到甄嬛有孕的消息感到震惊，悔恨自己一时大意，让甄嬛钻了空子。
为防止甄嬛回宫，皇后亲手策划了一系列好戏给别人看：先是进香香柱断裂不止，然后自己佯装失足落水，另一边安插他人候机在太后寿康宫里点火，闹得宫里是非不断。陵容候机在皇帝旁边煽风点火，并请来钦天监正使，以天象不详之名暗示甄嬛怀孕有不祥之兆，皇帝决定暂缓甄嬛回宫一事。
四阿哥弘历汤中被人下了毒，嬷嬷误食后惨死，恰巧让眉庄碰上，把弘历带到太后跟前。
后宫甄嬛传分集剧情介绍 第五十五集太后明白此举必是皇后所为，于是召来皇帝、皇后，以弘历之遭遇点醒皇帝，促成甄嬛回宫一事以平衡后宫势力，皇后几欲阻拦未果。
甄嬛去探望允礼生母舒太妃，告知自己怀了允礼骨肉，设计回宫是为了给允礼报仇。
甄嬛回宫前，皇后得知消息情知无法阻拦，特意怂恿皇帝大兴土木迎接甄嬛回宫，引得前朝言官非议，内外反对。为使甄嬛顺利回宫，皇帝决定为甄嬛改姓钮祜禄氏，封为熹妃，并称其为皇四子弘历的生母，甄嬛这才得以回宫。
果郡王逃出准葛尔生还，回宫拜见皇帝，却被皇帝指派去甘露寺接回新妃。果郡王与甄嬛重逢，大感命运弄人。甄嬛见不能回头，依旧狠心决定回宫。
